Αθώοι κρίθηκαν από το δικαστήριο οι Ρένα Δούρου (τότε περιφερειάρχης Αττικής), Ηλίας Ψινάκης (τότε δήμαρχος Μαραθώνα), Αντώνης Παλαπατζής, Βάιος Θανασιάς και Δημήτρης Στεργίου Καψάλης (αυτοδιοικητικοί), Χρήστος Λάμπρης (διευθυντής πυρόσβεσης και διάσωσης), Χρ. Δροσοπούλος (κυβερνήτης του ΦΛΟΓΑ), Γεώργιος Πορτοζουδης (διοικητής της ΥΕΜΣ), Στέφανος Κολοκούρης (τότε διοικητής της ΕΜΑΚ), Χαράλαμπος Συρογιάννης (πρώην υποδιοικητής εναέριων της ΕΛ.ΑΣ.) και Ευάγγελος Μπουρνούς (τότε δήμαρχος Ραφήνας).
Όπως ανέφερε η πρόεδρος του δικαστηρίου: «Δεν προέκυψε ο ενδεχόμενος δόλος για να μπορέσει να δομηθεί το αδίκημα της έκθεσης σε βαθμό κακουργήματος. Κατόπιν αυτών το δικαστήριο αποσύρεται για την αποχώρηση των αθωωθέντων».
Η απόφαση προκάλεσε έντονη αντίδραση από τους συγγενείς των θυμάτων της φονικής πυρκαγιάς στο Μάτι, οι οποίοι ξέσπασαν στην αίθουσα του δικαστηρίου φωνάζοντας: «Τα θύματα φταίνε», «Ντροπή», «Η ιστορία θα σας κρίνει».
Στις πρώτες σειρές των εδράνων, είχαν τοποθετήσει 120 λευκά τριαντάφυλλα, στη μνήμη των νεκρών. Έξω από τη δικαστική αίθουσα υπήρχαν 120 μαύρα μπαλόνια και πανό με συνθήματα όπως: «Κοιμήσου Ελλάδα, τα παιδιά σου δολοφονούνται», «Είμαστε μόνοι μας. Γιατί;», «Κανείς πουθενά», «Βοήθεια καίγομαι, βοήθεια πνίγομαι», «Καιγόμαστε».
Όταν οι δικαστές ανέβηκαν στην έδρα, αστυνομικοί απομάκρυναν τα λουλούδια από τις θέσεις, προκαλώντας νέα έκρηξη θυμού από τους συγγενείς. «Τα λουλούδια αυτά είναι για τις ψυχές για τους νεκρούς. Δεν ξεκινάνε καλά», ακούστηκε, ενώ μια γυναίκα κατήγγειλε με οργή: «Έπρεπε μόνοι τους να πάνε στη φυλακή, χέρι χέρι…».
Τα τριαντάφυλλα τελικά δόθηκαν πίσω στους συγγενείς, οι οποίοι τα κράτησαν στα χέρια τους κατά την ακρόαση της απόφασης.
Η εισαγγελέας της έδρας είχε εισηγηθεί την ενοχή 12 από τους 21 κατηγορούμενους, μεταξύ των οποίων στελέχη της Πυροσβεστικής όπως οι Σωτήρης Τερζούδης, Βασίλης Ματθαιόπουλος, Ιωάννης Φωστιέρης, Χρήστος Γκολφίνος, καθώς και η τότε περιφερειάρχης Αττικής Ρένα Δούρου και ο τότε δήμαρχος Ραφήνας-Πικερμίου Ευάγγελος Μπουρνούς.
Η αρχική (πρωτόδικη) απόφαση είχε προκαλέσει σφοδρές αντιδράσεις, καθώς μόνο έξι κατηγορούμενοι καταδικάστηκαν σε ποινές φυλάκισης, οι οποίες όμως ήταν μετατρέψιμες προς 10 ευρώ ημερησίως. Η Εισαγγελία είχε ασκήσει έφεση κατά της απόφασης, οδηγώντας όλους τους κατηγορούμενους ξανά στο εδώλιο, αυτή τη φορά για πλημμελήματα που συνεχίζουν να αρνούνται.